脑血栓的后遗症有很多，根据在急性期受损的部位不同而表现不同，最常见的是肢体瘫痪，即肢体的无力，患者会出现上肢的无力，上肢呈屈曲样、下肢伸直样，还有直角的步态；如果影响患者的感觉系统，患者还会出现肢体的麻木、感觉的减退，这种麻木和感觉的减退往往比肢体的无力恢复更慢，还有部分患者影响了语言中枢，会出现言语的障碍，吐字不清甚至一句话也说不出来；如果血栓侵犯了大脑皮层，患者可能还会有癫痫样发作，对于这类患者要长期的服用抗癫痫药；还有比较常见的后遗症是头晕，脑血栓患者尤其是侵犯小脑脑干的患者，头晕会持续很久，可能会持续一年、两年或者更久。